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PyMOL de código aberto para macOS

O PyMOL de código aberto está disponível gratuitamente e pode ser instalado por meio do gerenciador de pacotes Homebrew.

Este repositório fornece um método para instalar o PyMOL v2.6 no macOS. Se necessário, uma versão em inglês deste guia está disponível aqui.

Download e instalação

Siga estes passos para instalar o PyMOL v2.6:

  1. Instale o Homebrew:
/bin/bash -c "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/HEAD/install.sh)"

2. Instale as dependências do PyMOL (python, xquartz, tcl-tk, Qt5) usando o Homebrew:

```bash
brew install Caskroom/cask/xquartz
brew install tcl-tk
brew install python
pip install pyqt5
  1. Instale o PyMOL
brew install brewsci/bio/pymol
  1. Crie um executável de aplicativo para o PyMOL:
  • Abra o Automator, que está em Aplicativos no macOS.
  • Crie um novo documento, selecione “Aplicativo”.
  • Selecione “Ações” e “Biblioteca” no painel esquerdo. Selecione “Utilitários” e “Executar script de shell”. Arraste isso para o painel principal.
  • Escolha /bin/bash como um shell.
  • Cole o seguinte: /usr/local/bin/pymol -M. Se isso não funcionar, verifique o caminho para o PyMOL usando which pymol no terminal e use este em vez disso.
  • Salve o aplicativo (“Arquivo > Salvar”) na área de trabalho e nomeie-o como “PyMOL”.
  1. Inicie o PyMOL v2.6

No terminal, execute:

pymol

ou, você pode iniciar o PyMol clicando duas vezes no aplicativo criado na área de trabalho.